更多“多序列比对就是两条以上的序列进行比对,可以用于进化树分析、寻找保守区域等。”相关的问题
第1题
进化树构建包括以下哪些步骤?
A.选择合适的同源基因序列
B.序列比对
C.选择合适的方法构建进化树
D.评估进化树
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第2题
多序列比对运用局部比对,单序列与数据库比对常运用全局比对。
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第3题
NCBI BLAST工具只能进行核苷酸序列比对(blastn)和蛋白质序列比对(blastp)。
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第4题
选择感兴趣的一个具有完整编码区(CDS)的mRNA序列(每人1题,相互之间序列完全一致,均判0分),要求含有5’-UTR、CDS及3’-UTR。以该基因编码的蛋白序列为目的序列进行BlastP分析。在分析结果中下载与目的蛋白序列高同源的搜索蛋白序列,应用DNAMAN 5.0软件进行多序列比对。 要求:提交PDF格式文档至《生物信息学》精品在线开放课程平台。 注明该基因及其编码的蛋白质的序列号及蛋白质的主要生物学功能; 列出进行多序列比对的全部蛋白质的fasta格式序列; 应对5-10条蛋白序列进行多序列比对,每条序列以“序列号”命名。
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第5题
进行菌种鉴定时,可以通过PCR扩增(),测序后与数据库进行序列比对。
A.5.8S rDNA序列
B.28S rDNA序列
C.23S rDNA序列
D.16S rDNA序列
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第6题
进行菌种鉴定时,可以通过PCR扩增(),测序后与数据库进行序列比对。
A.5.8S rDNA序列
B.28S rDNA序列
C.23S rDNA序列
D.16S rDNA序列
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第7题
比对两条分别长7和9的序列,需要画多大的动态规划矩阵?()
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第8题
为附件中exercise1.fasta中的5条序列创建多序列比对。多序列比对工具自选。比对结果保存后通过JalView,以Clustalx颜色方案标记。将编辑后的多序列比对保存为图片提交。注意调整图片宽度及文字大小。自己尽量多的尝试一下JalView的各种功能,参考help。 JalView下载:附件中可下载Windows版JalView安装包(不含JAVA,JAVA安装参见第二章第二部分第7节:PDB文件3D展示Jsmol_附件) 课程不支持大于50M的附件上传,如需下载自带JAVA安装的Jalview安装文件或其他版本安装文件,请前往Jalview官网下载:https://www.jalview.org/Web_Installers/install.htm
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