分子标记育种是利用分子标记与决定目标性状基因紧密连锁的特点,通过检测分子标记,即可检测到目的基因的存在,达到选择目标性状的目的一种新型育种方法,具有快速、准确、不受环境条件干扰的优点。例如,某土豆品种综合性状非常优良,最大缺点是不抗病,这种情况下就可以找一个抗病品种与其杂交,前提是这个抗病基因位点具有典型可标记的性状,得到 F1 代后再与原品种回交,在回交后代中根据分子标记性状进行鉴定,保留抗病后代再与原品种回交,回交二代即可获得抗病且具有回交亲本主要优良性状的单株,大大加快了育种进程,减少了单株抗病鉴定的工作量。