重庆二级建造师不能在四川省注册的原因是，重庆二级建造师注册管理系统为渝快办一体化政务服务平台。从注册时间看，二级建造师注册时间为自资格证书核发之日起三年以内，如果三年有效期满，则需进行继续教育并申请延续注册。每一次注册的有效期只有三年。想要注册成为二级建造师的个人，需要提出初始注册申请并提交给注册企业审查。注册企业审批后，提交给地市主管部门申请审核。经地市主管部门批准后，再加入汇总批次，将批次上报给省厅主管部门审核。只有省级主管部门终审通过后，才能打印证书并发放。
总结以上流程，重庆二级建造师只能在重庆市进行注册，不能在四川省注册。如果您想成为重庆二级建造师，需要了解上述流程并按照要求进行操作。
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